
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱动物 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究方案结杲
设计工人科学探究随着时段的推移速冻时段延缓牛羊肉片的强度标准、持水、光色、解离铁成分、ROS、脂质过被金属氧化物、MDA、GSH和GPX4水平面来评价健身肌肉团队神经组织的铁死掉程序。最终结果彰显,速冻时段延缓后,牛羊肉片的强度标准在第8天和第6天差异性下滑;持水功能大大减少;茶汤颜色变深,流失亮泽,鲜红颜色转为暗红颜色。凡此种种,解离铁、灵活性氧和MDA的成分差异性增多,神经组织凋亡率差异性提高。 探讨人群拆分各个冷冻日期的健身健身肌肉印刷品的球脂肪酸,第二步对其进行SDS-PAGE解析,球脂肪酸条带在各个南北朝时期布置平均且类似的(图1a)。可根据球淀粉酶酶在各个印刷品中的展现情形,解析发觉同个组印刷品的中十位数差别不大的外表于同个级别(图1b),描述健身健身肌肉印刷品球脂肪酸含有良好的的组内类似的性和组间差异化性。 核营养物质组学共亲子认定出1996种核营养物质。以B0为剖析组,淘汰B1、B2、B4和B6中的核淀粉酶质酶参与差别的表现解析,共亲子认定到375个DEPs。将火山图可视化管理,并据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05俩个准则解析DEP。导致下图1c-f一样,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别亲子认定出22、33、73和140个DEPs,当中别调整6、11、32和89个,变动16、22、41和51个。聚类算法方案分析评估了各不相同食品冷藏时段相关肌进行中核营养物质的表现,导致体现相关肌核淀粉酶质酶表现差别的伴随存放事件的多而多(图1g)。
图1| 不同于冷冻箱的时间的肌样品管理球营养物质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有一定的差异冷库時间的腿部肌肉打样定制一定的差异蛋白质分折(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身亡球蛋白肽的PRM参考值深入分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 系统设计KEGG生物富集对比分析表明核蛋白的铁窒息死亡管理机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人心得体会
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物工程提供了TMT参考值淀粉酶质组学工艺安全工作,拜谱微生物已开发完成任务并制定了逐步完善稳定的转录组学、淀粉酶组学、代谢率组学或是几组学联合的技术货品工艺安全工作模式,欢迎致电咨询!
参考使用学术论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.