SUMO化呈现都是种极为重要的反译后呈现，SUMO原子核依据在E1产甲烷酶、E2依照酶和E3接连酶的参与性下共价依照说到底物球淀粉酶酶赖氨酸残基上，在操纵藤本动树种萌发、鲜香美味警报减弱和胁迫不起功效中起着极为重要功效。SUMO化球淀粉酶酶和SUMO呈现全过程中 中相关酶的失常都能造成的藤本动树种萌发失常以及阵亡，这反映出SUMO化呈现在设定藤本动树种萌发健康成长全过程中 中起着核心区功效。可能当前在藤本动树种中被判定出的SUMO化球淀粉酶酶比例较少，但会SUMO 化在藤本动树种中的丰度较低且动态的性较高，往往判定SUMO化球淀粉酶酶和 SUMO化位点是甚为具备有对决性的。

2024年9月18日，南方科技大学的王鹏程副教授（拜谱菌物进行合作科学有效家）及其研究团队在Nature Plants上发表了题为“Highly sensitive site-specific SUMOylation proteomics in Arabidopsis”的研究论文。该论文通过向拟南芥sumo1 sumo2突变体中插入赖氨酸缺失的SUMO1基因（K0-SUMO1），以建造了了种第二步赖氨酸欠缺SUMO含有技术，倡导了奔驰e敞篷的绿植的SUMO化核蛋白组动态数据表，为进一步探索SUMO化如何调节蛋白质功能提供了宝贵资源。

英文版选择题：Highly sensitive site-specific SUMOylation proteomics in Arabidopsis

中文版题：拟南芥中高度敏感的位点特异性SUMO化蛋白质组学

发表过论文期刊：Nature Plants

关系细胞因子：15.8

钻研总体目标

图1研究方案难点图

学习最终

01、拟南芥K0-SUMO1球膳食纤维成分析

先前的研究表明sumo1-1、sumo2-1双突变体是没有办法正常发育的，因此作者先将K0-SUMO1基因片段导入sumo1-1、sumo2-1双突变体中，发现植物生长基本正常，并且通过Western Blot实验观察到K0-SUMO1植物中的蛋白可能具有功能性。因此，笔者进一大步凭借提高的第二步亲和丰度的办法开始质谱具体分析，共鉴定到2000+个独特的SUMO化位点、1300个SUMO化蛋白，其中拟南芥SUMO化位点的位置更加多样化，会发生在不同的基序上，与其他真核生物不同。SUMO化蛋白质组的GO功能分析发现检测到的蛋白质主要在不同的核过程发挥作用，包括基因沉默、基因调控以及DNA修饰和修复。

图2 SUMO化体现蛋白质含量质组（图源：Sang T et al., Nat Plants, 2024）

02、SUMO化呈现蛋白质和位点的验正

关键在于安全验证隐性的SUMO1核蛋白，本研究通过原核表达系统获得重组SUMO化蛋白，并来了离体测试。作者随机选择了九个候选蛋白，通过免疫印迹法发现在SUMO1蛋白存在的情况下，这些候选蛋白都可以发生SUMO化。随后使用野生型和位点突变的重组SUMO1蛋白进行了体外SUMO化实验，以证实SUMO化装饰位点，实验结果表明多个鉴定到的底物位点在体外仍可以发生SUMO化修饰。综上所述，SUMO化位点的定点突变和体外SUMO化实验进一步验证了组学方法鉴定结果的准确性。

图3 SUMO化蛋白酶和位点的体内效验（图源：Sang T et al., Nat Plants, 2024）

03、热重置蛋清质组的参考值更加

前面的实验结果发现在高温胁迫的拟南芥幼苗中鉴定出了1300个SUMO化蛋白。为了进一步评估SUMO化修饰如何调节蛋白质功能，本研究通过TMT核高蛋白组学比较了热应激前后潜在SUMO化蛋白丰度变化。结果发现在30分钟热应激后，有1,666个和429个蛋白质分别显示出明显上调和下调。在SUMO化的底物中，共鉴定出435个蛋白质，其中有128个蛋白质上调，16个蛋白质下调。因此，这些结果表明SUMO化修饰可能与目标蛋白质的稳定性增加相关。

图4 立于TMT的化学发光法蛋白酶质组学（图源：Sang T et al., Nat Plants, 2024）

拜谱工作小结

本研究从血清质组的分析角度提供了关于SUMO化作用的生物学功能和位点特异性的信息。通过将赖氨酸缺失突变体SOMO1（K0-SUMO1）引入转基因拟南芥，以树立一类敏锐度较高的SUMO化蛋白质纯化和质谱加测的办法。这种方法从热处理的KO-SUMO1幼苗的1300个SUMO1蛋白中鉴定出超过2200个SUMO1化位点，并通过体外实验验证了方法的准确性，显著地加深了我们对植物SUMO1的理解。热打断血清按量非常表明SUMO化修饰增强了SUMO1受体的稳定性。总之，本研究为SUMO化修饰的检测提供了新的方法，为探索SUMO化蛋白功能奠定了重要基础。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供蛋白组、修饰组、代谢组、转录组、时空组等组学产品，SUMO化表达血清质组作为一个我公司特点表达的产品，用到有效的丰度新技术、尖部的Astral器材可保证 SUMO化血清和位点的优质化量排除。此外，王鹏程教学当做拜谱有关专家团队成员英文，在產品研究开发时候中为我们具备靠谱意见和建议和免费指导，以更好的产品回馈大家，欢迎大家咨询！

考虑文章：Sang T, Xu Y, Qin G, et al. Highly sensitive site-specific SUMOylation proteomics in Arabidopsis. Nat Plants. 2024;10(9):1330-1342. doi: 10.1038/s41477-024-01783-z.