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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 互联网药剂学学证明草酸钙肾结石氧化物应激反应和细菌感染拉伤逻辑

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿控制体系常用见的常见疾病组成。肾安排中CaOx单晶体过是处于饱和状态沉淀积累会造成肾小管癌细胞伤害和凋亡,最后造成肾结石的形成了。短链乳酸酸由肠胃内厌氧反应器螨虫沤肥合理膳食氯纶出现,往往在一部分肠胃防御体系中起到效应,并且在控制体系的水平上也起到关键点效应。进来,丁酸是最丰富多彩的短链乳酸酸,极具抗感染和免疫性阻止效应,本钻研浅议丁酸对CaOx肾结石的效应极其不确定靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山三甲医院泌尿美容外科吴忠教学、周子健研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教受、周子健搏士在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物制品与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网格药理学学工作,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

的文章明称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 加盟商行业:华山医生 实验相亲对象:大鼠、HK-2血细胞 组群消息:剖析组(Con)、型号组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱给予技木:wifi网络临床药理学在线检测

工作思路的过程流程图

设计报告

钻研员要整合大鼠模式,能够顺利血生化目标和集体疾病学印染等钻研手法出现 丁酸可以减掉CaOx模式大鼠肾CaOx晶状体的建成和拉伤,调理CaOx模式大鼠的支原体感染拉伤和阳极钝化物的过于把你想表达出来。显然,丁酸还可减弱草酸促进的HK-2血細胞拉伤、阳极钝化应激性和血細胞凋亡。 为探讨丁酸形式类型和靶染色体网咯,研发人员管理从PubChem更改丁酸和丁酸酯的二维和立体形式类型(图1A)。经由PharmMapper的数据源源库和Uniprot的数据源源库治理 后共建立出11八个丁酸靶染色体供进一步推动骤浅析。将染色体表单把手机通讯录STRING的数据源源库,开始PPI网咯浅析。Cytoscape明确了筛选的前20的核心靶染色体的详细分享网咯图,属于CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这种核心染色体与网咯中的其余染色体均的表现出固定的涉及到性,情况说明这种染色体有机会起着效用着协作效用。GO和KEGG浅析体现了丁酸核心染色体的涉及到路径和怪物学效果(图1C)。核心染色体关键与类固醇荷尔蒙初次回应、脱色应激性性初次回应、活力性氧组织细胞对类固醇荷尔蒙畅快的化学不良体现不良体现相应对酸碱性化学不良体现物资的化学不良体现不良体现有关的信息。综上所讲所讲,这种核心染色体关键体验了脱色应激性性和对活力性氧的怪物化学不良体现不良体现过程中 ,是肾结石构成原则中至关比较重要的的路径,这认为丁酸有机会在肾结石中起着效用比较重要的效用。

图1| 丁酸型式与靶基因组在线剖析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进三步深入钻研丁酸对CaOx肾结石确确实实切靶dna,钻研师充分利用GEO数据分析信息库对GSE73680中稳定剖析与CaOx肾结石人群的dna不同之处开展了钻研。剖析组与CaOx结石人群的关联系数性不同之处展示方法dna(DEGs)检查的标准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共淘汰到3783个dna时有发生关联系数发生改变,在当中3379个(89.4%)dna展示方法调整,404个(10.6%)dna展示方法上涨(图2A)。对DEGs开展聚类分析了解法了解,热图表示了前10个被选中DEGs的二维分出层次聚类分析了解法基本特征(图2B)。陆陆续续,钻研师利用GeneCards数据分析信息库人工客服电话检测了370个可能性与CaOx肾结石关联的dna,排明前20位的预估dna下列不属于关联性評分如下图2C右图。成了遇到丁酸治療CaOx肾结石的要素靶点,钻研师将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石关联dna操作得到了半个个Venn图。然后,CYP2C9被确认为丁酸的影响CaOx肾结石的内在的靶点(图2D)。除此以外,钻研师还开展了丁酸与CYP2C9的氧分子接入,CYP2C9的三大氨基残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸相互间功用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在回收利用互联网临床药理学预计CYP2C9是丁酸影响力CaOx肾结石的靶基因组后,的研究工作员还经过细胞系系实验性印证了CYP2C9可降低草酸诱发的HK-2细胞系系的ROS程度、炎症病变破损和凋亡。

图2| 部分据库联动研究分析预测CYP2C9是丁酸效应于CaOx肾结石的靶染色体

科研没想到

本钻研第一方面显示丁酸在身体和体內均能可减弱性CaOx肾结石模板的脱色应激反应反应和感染软组织磨损,很快借助线上临床临床药理学需求有丁酸导致CaOx肾结石的风险靶点——CYP2C9,接下来借助内部实验所可确认CYP2C9在草酸盐引导的HK-2内部ROS标准、感染软组织磨损和凋亡。此类显示表示丁酸有机会借助可减弱性CYP2C9来可减弱性CaOx肾结石的脱色应激反应反应,缓解感染软组织磨损。一种操作过程中拜谱生态学展示 了线上临床临床药理学技術保障性,不仅如此拜谱生态学可增强成熟稳定进一步优化的什么是基因组学、蛋清质组学、细胞代谢组学等多个学类产品及技術保障性,邀请垂询质询! 考虑论文文献:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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