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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T淋巴淋巴肉瘤人体内部膜并能掌握淋巴淋巴肉瘤淋巴淋巴肉瘤人体内部膜单单从表面的基本团队结构相匹配性和好体(MHC)呈递的抗原而重置抗体发应。MHC I类(MHC-I)原子与CD8+ T淋巴淋巴肉瘤人体内部膜之间的影响,其呈递的肽基本特征于内源性胞质血清的血清酶体挥发,而MHC II类(MHC-II)原子基本抒发于技术专业抗原提呈淋巴淋巴肉瘤人体内部膜,与CD4+ T淋巴淋巴肉瘤人体内部膜之间的影响,其呈递的肽位于要内体行业挥发的胞外和胞内血清(图1)。如此,掌握由MHC原子呈递的淋巴淋巴肉瘤抗原关于构思依赖症T淋巴淋巴肉瘤人体内部膜掌握和杀掉淋巴淋巴肉瘤淋巴淋巴肉瘤人体内部膜的有效果和人身安全的良性肿瘤抗体治疗是是重中之重性的。因为质谱(MS)的抗体肽组学(Immunopeptidomics)并能从几种淋巴淋巴肉瘤人体内部膜系、淋巴淋巴肉瘤团队结构和身体健康团队结构中高通芯片量、一直评定MHC融入肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗原生物富集MHC简答配合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫力肽回文序列与翻泽后淡化消息,提高基因测序的真实度,并采用De novo从头至尾测序技术性,不依赖现有数据库,更多通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰富多样的数据浅析浅析信息为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递肺部肿瘤抗原的途经

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

NO.1 测试程序流程

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典例解析

01 新机制探讨

原创文章题型:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

撤稿半月刊:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)不是种核打出淀粉酶,在癌症复发中习惯性过形容,做以为淋巴肿瘤发生了的驱程因素分析。现有,靶向治疗XPO1的小分子式正被作为临床药理防癌药物治疗。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫性肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 的始于XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 恶性肿瘤-免疫抗体医疗

本文选择题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

撤稿月刊:Nature Communications IF:16.6 2023

恶劣胸膜间皮瘤(MPM)就不是种生存率劣质的侵蚀性恶性肿瘤。根据目前的手术疗法方式缺少疗法效果,这样迫在眉睫要有新的手术疗法方式。因为其T细胞系浸润性,我们比如MPM就不是个好的手术疗法性癌症晚期狂犬疫苗的阶段目标。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用来源于质谱的免疫检测肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶性肿瘤胸膜间皮瘤免疫力肽组学判断

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 病菌mRNA接种疫苗发掘

篇文章大题目:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

刊登杂质:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过依托于质谱的免疫检测肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌影响的Hela肿瘤生殖细胞和HCT-116肿瘤生殖细胞中技术鉴定MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱总结

抗体检测肽组学是血清酶质组学的一家便捷发展壮大的结点,它专心于探索抗体检测程序中由一般企业相匹配性塑料体(MHC)或人类白血球系抗原(HLA)原子核呈递的抗体检测肽。这类抗体检测肽是体神经元核系外表面呈递的肽段,够被T体神经元核系识别图片,最终得以释放抗体检测影响。研究背景质谱的抗体检测肽组学以及将成为评定MHC血清酶呈递肽的金规格步骤,够直观评定有所差异生理特点和疾病程序下有所差异企业和体神经元核系内型中的抗体检测肽组,假如三维线瘤或类病毒交叉感染的体神经元核系。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的血清组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的天然免疫肽组测量提供服务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,能够精准且真接可以提供抗体肽回文序列,发掘更大非常见抗体肽,逐级需求出稳定新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

参阅论文

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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