
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用遮盖淀粉酶组学产品,实现1000+玄之又玄度表达位点查出,平衡再次出现经典传奇靶点,全位子生信了解解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“察觉到”到“安全验证”全工艺流程服务培训,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、进行实验方法
02、监测数据源
03、经“点”显现
在亲测统计数据中,查出很多论文资料中新闻的经典的靶点还会有其衣康酸呈现位点,如独另一个被出现的衣康酸共价呈现淀粉酶KEAP1,还会有糖酵解径路中的3个重中之重酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,或是炎性小体组成部分淀粉酶NLRP3和受损细胞死亡过程中 中的重中之重淀粉酶RIPK3等,其质谱图如下图下图图下图。
04、企业产品作用
1.几斤质控
服务业化特情人探头孵育、SDS-PAGE加测、WB核实、子样本相应性介绍等各坐向加测,保证品牌最终结果是真的吗性。2.高特性质谱检测设备游戏平台
在Orbitrap Astral全新第二代高判断质谱仪带动下,控制衣康硝化作用体现位点及蛋白酶监定新纵深,注力学科研发新出现 。3.全流程图站台式工作
根据拜谱生物工程逐步完善的的在线检测网上平台,可供给“细胞膜培養→探头孵育→WB的在线检测→深奥度衣康过酸表达的在线检测→独有生信研究分析→指定位点PRM认可”全方法功能,省时保持平衡更先问。05、分享项目(一些)
06、操作方法
PART 2、论文qq分享
专著一
日文微信标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
汉语微信标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
研究分析资源:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
文章二
英语怎么说问题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
简体中文子标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
设计信息内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、装修案例衍生产品设想
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13兼备弱于的底物组合效果,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生物技术衣康碱化遮盖组实测值数据源中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康碱化表达(有以下几点图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱总结
对于TCA重复中的在期间基础基础分解物,衣康酸自动调节基础基础分解、免疫力力力和慢性发病期间的彼此之间作用,为中药制疗免疫力力力慢性发病性发病带来了了代替中药制疗攻略。衣康酸构造中的亲电性α,β-不饱和状态羧酸构造能对蛋清质上的吸附性半胱氨酸残基确定烷基化表达(迈克尔加强不良反应),这一个翻译资料后表达被称做“衣康酸表达(itaconation)”,行而作用蛋清质性能,调空免疫力力力初次应答和基础基础分解路经,为多类发病口服药物研发团队带来了新总体目标。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应掩盖血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医药学绝对是降钙素原检测靶向药物产生组(QMT1000)或能量场分泌靶点分泌组企业产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
借鉴专著
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.